Phụ gia thực phẩm ngoài chuyện làm tăng cmả quan thực phẩm, còn có thể là nguyên nhân của những vấn đề về sức khỏe nghiêm trọng, không loại trừ cả ngộ độc đưa đến tử vong như suy gan, suy thận, ngộ độc thần kinh, ung thư, rối lọan tiêu hóa... do đó việc dùng phụ gia thực phẩm theo đúng quy chuẩn là vô cùng quan trọng cho sức khỏe con người.